L’enseignement supérieur grec est constitué du secteur universitaire – qui comprend 24 universités publiques. Ces établissements sont accrédités par l’État. La durée des programmes de premier cycle pour la plupart des disciplines est de 4 ans, mais il existe des programmes d’ingénierie, de dentisterie, de pharmacologie, d’agronomie, de sylviculture et de beaux-arts d’une durée de 5 ans et de médecine d’une durée de 6 ans. Ces crédits sont accumulés et transférables dans le cadre du système européen de transfert et d’accumulation de crédits (ECTS). Les programmes d’ingénierie, de dentisterie, de pharmacologie, d’agronomie, de sylviculture, ainsi que certains programmes de beaux-arts, ont une durée de 5 ans (240 ECTS – 300 ECTS). La médecine est la seule discipline dont la durée des études est de 6 ans.

La Constitution grecque actuelle interdit aux établissements privés d’enseignement post-secondaire, appelés collèges, de fonctionner comme des universités indépendantes en Grèce. Toutefois, elle n’interdit pas aux collèges de collaborer avec des universités étrangères pour offrir des programmes d’études de premier et de deuxième cycle en Grèce.

La grande majorité des collèges offrent des programmes d’études dans le cadre d’accords de franchise ou de validation avec des universités établies dans d’autres pays de l’Union européenne, principalement au Royaume-Uni, conduisant à des diplômes qui sont délivrés directement par ces universités. Le contrôle de ces accords ainsi que des dispositions complémentaires pour le fonctionnement des collèges est effectué par le ministère de l’éducation. Grâce à l’intégration dans la législation grecque de la directive 2005/36/CE relative à la reconnaissance mutuelle des qualifications, les titulaires de diplômes universitaires délivrés par des universités de l’Union européenne, y compris ceux obtenus par des études dans un collège en Grèce, voient leurs droits professionnels pleinement reconnus.

Les études de troisième cycle conduisent à l’obtention d’un diplôme de spécialisation de troisième cycle (Master). L’objectif général des études de troisième cycle est d’offrir aux étudiants la possibilité de se spécialiser dans certains domaines. Les cours de troisième cycle sont ouverts aux diplômés grecs ou étrangers des universités grecques, ou des instituts étrangers équivalents accrédités. Les conditions d’admission, les critères de sélection pris en compte, les frais de scolarité (dans les cours et la procédure d’admission sont déterminés par le règlement interne du programme de troisième cycle en question. En général, les candidats sont choisis sur la base d’un processus de sélection ou de leurs résultats aux examens (oraux et/ou écrits). 

Bien que les programmes d’enseignement soient principalement offerts en langue grecque, un nombre croissant de programmes de troisième cycle sont proposés en anglais ou dans d’autres langues. La connaissance d’une ou plusieurs langues étrangères (autres que le grec) est une condition préalable essentielle à la participation aux programmes de troisième cycle. À la fin de leurs études, les étudiants doivent préparer et présenter leur thèse de master. Les cours durent normalement un an et demi (trois semestres), y compris le temps de préparation de la thèse. Dans le but de stimuler l’internationalisation de l’enseignement supérieur grec, de nombreux programmes de troisième cycle ont établi des collaborations avec des universités étrangères, délivrant des diplômes conjoints.

Le projet Study in Greece, en collaboration avec le Ministère de l’Éducation et des Affaires religieuses, a développé et gère le portail officiel répertoriant tous les masters proposés par les établissements d’enseignement supérieur grecs.

Les établissements d’enseignement supérieur proposent également une grande variété de programmes de troisième cycle, en grec aussi en anglais, dont beaucoup en collaboration avec des universités internationales.

Les études doctorales conduisent à l’obtention d’un doctorat (PhD). L’objectif général des études doctorales consiste en une spécialisation de haut niveau dans des domaines stratégiques de la connaissance et la promotion de la recherche fondamentale dans divers champs scientifiques en vue de renforcer la base scientifique du pays. Il est essentiel d’être titulaire d’un diplôme de troisième cycle afin d’obtenir un doctorat. L’autorisation de préparer une thèse de PhD dans les universités qui n’offrent pas de programmes réguliers de troisième cycle est accordée aux candidats qui remplissent certaines conditions préalables. Les départements fixent eux-mêmes les conditions d’admission.